Promoter Là Gì
Error message
Deprecated function: The each() function is deprecated. This message will be suppressed on further calls in _menu_load_objects() (line 579 of /home/tanhailonghotel.com.vn/GIT/vjs/main_website/includes/menu.inc).Bạn đang xem: Promoter là gì
Tác giả: Nguyễn Thị Tuyết (Đại Học khoa học Tự Nhiên, TP. HCM)
Promoter lõi (Core promoter) nằm trong vùng promoter cất vị trí bắt đầu phiên mã nghỉ ngơi sinh đồ vật nhân thực. Tại đây, quá trình khởi đầu phiên mã được kiểm soát ngặt nghèo bởi nhiều nguyên lý khác nhau. Từng một thứ hạng promoter lõi chịu trách nhiệm cho quy trình phiên mã ra những mRNA không giống nhau cần thiết cho nhiều quá trình khác nhau trong cơ thể. Vậy điểm lưu ý nào của promoter lõi ảnh hưởng tác động đến quá trình khởi đầu phiên mã ?
Đặc điểm promoter lõi
Cấu trúc cơ bản của một promoter
Promoter là vùng trình tự bên trên gen cần thiết trong quy trình phiên mã những mRNA nghỉ ngơi sinh trang bị nhân thực. Vùng promoter gồm cha vùng chủ yếu là promoter lõi, cận biên promoter cùng ngoại biên promoter (Hình 1).
Hình 1: Sơ thiết bị vùng promoter nghỉ ngơi sinh đồ dùng nhân thực. Vùng promoter tất cả 3 phần: promoter lõi, cận biên promoter và ngoại biên promoter. Trên vùng promoter lõi, các yếu tố phiên mã TFIIA, TFIIB, TFIIH, TFIIE kết phù hợp với RNA polymerase II tạo thành tinh vi tiền phiên mã. Các nhân tố ở các vùng cận biên cùng ngoại biên promoter tác động đến hoạt động vui chơi của phức phù hợp tiền phiên mã.
Promoter lõi hay nằm địa điểm -35 về phía thượng nguồn của gen và được coi là chìa khóa trong thừa trình mở màn phiên mã. Vùng promoter lõi đựng vị trí khởi đầu phiên mã TSS (Transcription Start Site), vị trí bám của RNA polymerase II và các yếu tố phiên mã GTFs (General Transcription Factors).
Vùng cận biên (proximal) promoter: nằm ở trong phần -250 về phía thượng nguồn gen. Vùng này thường xuyên chứa các trình tự nhận biết của những yếu tố phiên mã quan trọng có sứ mệnh trong ổn định quá trình hoạt động vui chơi của phức hòa hợp tiền phiên mã.
Vùng ngoại biên (distal) promoter: nằm ở khoảng cách xa đối với vùng promoter lõi. Vùng nước ngoài biên thường chứa những trình tự nhận thấy của các yếu tố đặc biệt, những trình tự cân bằng phiên mã, và các vùng tăng tốc phiên mã (enhancer).
(*các vùng cân bằng và các vùng enhancer có thể nằm hoặc không nằm ở vùng nước ngoài biên promoter. Các vùng này không dựa vào vào vị trí cùng chiều của RNA polymerase II).
Đặc điểm promoter lõi
Đặc điểm cấu tạo của vùng promoter lõi được biểu hiện qua trình từ acid nucleotide. Sự đa hình trong trình từ vùng promoter lõi khiến cho các vẻ bên ngoài promoter lõi mang các đặc trưng không giống nhau. Các promoter lõi sinh hoạt sinh đồ gia dụng nhân thực được phân thành 3 kiểu chủ yếu dựa vào điểm lưu ý về trình từ bỏ nucleotide, nucleosome và công dụng của gene (Hình 2).
Hình 2: cha kiểu promoter thường gặp gỡ ở sinh thiết bị nhân thực. (a) promoter lõi của gen chịu trách nhiệm cho quy trình biệt hóa thành những mô ở động vật hữu nhũ với ruồi giấm đều sở hữu chứa hộp TATA với yếu tố Inr; (b, c) trong những lúc đó, promoter lõi của gen giữ lại nhà cùng gen mã hóa mang đến các nhân tố phát triển ở động vật hoang dã hữu nhũ và ruồi giấm gồm sự khác biệt. Ở động vật hữu nhũ, promoter lõi chồng lắp lên những đảo CG. Trong những khi đó, đối với ruồi giấm, các core promoter chống lắp lên những trình trường đoản cú Ohler 6 với Ohler 1.
Đối với những promoter của gen chịu trách nhiệm trong quá trình biệt hóa thành những mô trong khung hình có những điểm sáng như: vùng promoter lõi bao gồm sự tập trung, vị trí những nucleosome bất chợt ở vùng promoter lõi. Vào vùng trình trường đoản cú của promoter lõi (ở cả động vật hoang dã hữu nhũ cùng ruồi giấm) có chứa trình tự hộp TATA với yếu tố Inr. Khi các histone H3 ở nucleosome sinh sống vùng này được trimethyl hóa sống Lysine thiết bị 4 và được acetyl hóa ngơi nghỉ Lysine sản phẩm công nghệ 27 thì vùng ren này sẽ tiến hành hoạt hóa và ban đầu phiên mã.
Xem thêm: Cách Xào Khoai Tây Với Cà Chua Lạ Miệng Cho Bữa Ăn Thanh Đạm
Ở các gen duy trì nhà, vùng promoter ở giữa các nucleosome có khoảng cách rộng cùng với sự phân tán của trình tự vị trí bám cho những yếu tố phiên mã, vị trí các nucleosome được xác định. Ko kể ra, gồm sự khác biệt trong trình từ promoter ở động vật và con ruồi giấm. Ở hễ vật, vùng promoter lõi bao gồm sự ông xã lắp lên các đảo CG. Ở ruồi giấm, vùng promoter lõi tất cả sự ông chồng lắp lên các trình từ Ohler 1 cùng Ohler 6. Ngoài ra, ngơi nghỉ vùng này còn chứa nhân tố liên quan đến quá trình xào nấu DNA (DRE – DNA replication related elements).
Vùng promoter ở những gen phụ trách cho quá trình phát triển cơ thể có cấu tạo tương trường đoản cú với gen giữ nhà: trình tự địa điểm bám cho những yếu tố phiên mã tất cả sự phân tán, và vị trí nucleosome được xác định. Ở đụng vật, vùng promoter lõi cũng ông xã lắp lên các đảo CG. Trong những khi đó, promoter sinh hoạt ruồi giấm gồm chứa nhân tố Inr đi thuộc với những yếu tố promoter hạ mối cung cấp (DPE - downstream promoter element).
Vị trí của những nucleosome H3 được trimethyl hóa ở Lysine sản phẩm 4 và được acetyl hóa nghỉ ngơi Lysine trang bị 27 chất nhận được xác định vị trí buổi giao lưu của gen giữ nhà và gen chịu trách nhiệm cho sự vạc triển. Không tính ra, sự hoạt động vui chơi của gen phụ trách cho sự cách tân và phát triển sẽ sống trạng thái thăng bằng hoặc chấm dứt hoạt hễ khi Histone H3 được trimethyl hóa sinh hoạt Lysine 27.
Vai trò của promoter lõi trong vượt trình bắt đầu phiên mã
Promoter lõi bao gồm vai trò vào việc cung cấp sự đính ráp phức hợp tiền phiên mã PIC (pre-transcription initiation complex) bao gồm: RNA polymerase II và các yếu tố phiên mã khác (general transcription factors). Những trình tự trong vùng promoter vận động như biểu hiện hướng dẫn cho các yếu tố phiên mã bám lên và thực hiện chức năng. Từng một giao diện promoter không giống nhau sẽ có các trình tự nucleotide không giống nhau và dẫn đến các yếu tố bám tương ứng cũng khác nhau (Bảng 1).
Bảng 1: những kiểu promoter và các yếu tố bám
Từ bảng 1, có thể thấy mẫu mã trình từ nucleotide tại vùng promoter lõi đưa ra quyết định các nhân tố nào sẽ bám lên để bắt đầu quá trình phiên mã. Ngoại trừ ra, sự xuất hiện của những kiểu trình trường đoản cú này còn phụ thuộc vào vào loài. Trình trường đoản cú trên vỏ hộp TATA được nhân tố TBP nhận diện và bám lên. Quy trình này theo tiếp nối là sự thu xếp và ổn định phức tạp tiền phiên mã PIC. Hộp TATA là trong số những trình tự bắt đầu phiên mã bảo đảm từ mộc nhĩ men, ruồi giấm cho tới người. Ngược lại, yếu tố Inr làm việc promoter lõi ở bạn và ruồi lại sở hữu sự biệt lập với nhau với thường hiếm chạm mặt ở ruồi. Không tính ra, giữa những vùng promoter thiếu hộp TATA hay sẽ xuất hiện thêm yếu tố Inr thuộc với các kiểu trình tự khác ví như yếu tố phiên mã hạ nguồn (DPE – downstream promoter elements). Những kiểu trình trường đoản cú Ohler cùng pause stop thường gặp mặt ở bạn và hiếm chạm chán hoặc không xác định ở ruồi.
Lời kết
Vùng promoter lõi tất cả vị trí quan trọng đặc biệt trong bức ảnh phiên mã ở sinh trang bị nhân thực. Tại đây, nhiều cơ chế sinh học tập phân tử tinh vi được diễn ra và kiểm soát ngặt nghèo bởi nhiều yếu tố khác nhau: trong nội tại vùng promoter lõi, các vùng cận biên với ngoại biên promoter và thậm chí là các yếu tố kế bên vùng promoter. Những kiểu promoter lõi khác biệt đặc trưng cho các gen không giống nhau. Các phân tích về sệt điểm, công dụng và chuyển động ở vùng promoter sẽ mở hé mở nhiều “sự thật” trong quy trình sinh trưởng và cải cách và phát triển ở sinh vật. Tuy nhiên, promoter cùng promoter lõi vẫn còn chứa nhiều bí hiểm cần được phân tích và đi khám phá.
Tham khảo: Haberle, V., và Stark, A. (2018). Eukaryotic core promoters and the functional basis of transcription initiation. Nature đánh giá Molecular Cell Biology, 1.
*Chú ưng ý bảng 1:
Hộp TATA (TATA –box): hộp TATA là một trong những đoạn trình tự DNA nằm ở vùng promoter ở đa số các gen. Hộp TATA thường là vị trí bám của những yếu tố mở màn phiên mã. Trình trường đoản cú thường chạm chán là 5" TATAAA(A/G) 3".
Xem thêm: Du Lịch Đài Loan Có Gì Hay, Có Nên Đi Du Lịch Đài Loan
Yếu tố Inr: có tác dụng tương tự như hộp TATA. Nguyên tố Inr thường chứa trình tự nhấn diện cho yếu tố phiên mã IID (TFIID – transcription factor IID).
